اداره خوابگاه ها با هدف واگذاری خوابگاه و اسکان دانشجویان غیر بومی و ایجاد محیطی مناسب برای​ دانشجویان انجام وظیفه می نماید.

دانشگاه قم در حال حاضر دارای 6 سرای ملکی (3 سرای دانشجویی کوثر، فاطمیه،​ معصومیه مختص خواهران و 3 سرای دانشجویی الغدیر، گل آور و میر باقری مختص برادران) با امکانات نمازخانه، سالن مطالعه، مرکز مشاوره، سالن تلویزیون، محوطه فضای سبز اختصاصی، سالن تندرستی، زمین بازی والیبال و بسکتبال، فروشگاه مواد غذایی می باشد که به دانشجویان غیربومی کلیه مقاطع تحصیلی در سنوات مجاز آموزشی برابر قوانین و مقررات خدمات خوابگاهی ارائه می کند.. همچنین دانشگاه قم دارای 14 واحد خوابگاه متاهلین می باشد.